清華大學核能與新能源技術(shù)研究院(簡稱核研院)籌建于1958年，始建于1960年1月。早期稱清華大學原子能基地，1962年起更名為清華大學試驗化工廠（簡稱試化廠）。1979年4月經(jīng)學校批準更名為核能技術(shù)研究所（簡稱核能所）。1990年11月10日，經(jīng)國家教委批準更名為核能技術(shù)設(shè)計研究院（簡稱核研院）。2003年9月經(jīng)清華大學2003-2004學年度第1次校務(wù)會議討論通過，更名為核能與新能源技術(shù)研究院（簡稱核研院）。更名后原有設(shè)計院資質(zhì)保留，名稱仍為“清華大學核能技術(shù)設(shè)計研究院”。

核研院俗稱“200號”，這是屏蔽試驗反應(yīng)堆最初在校內(nèi)基建項目的編號。1964年，清華大學有關(guān)專業(yè)師生建成了屏蔽試驗反應(yīng)堆，完成了動力堆屏蔽等實驗，這是我國第一座自行研究、設(shè)計、調(diào)試、運行的核反應(yīng)堆，為我國核能事業(yè)的發(fā)展做出了重要貢獻。